1994 ж. – Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Ұлттық Жоғары Мемлекеттік басқару мектебі (ҰЖМБМ) ашылды (Қазақ КСР ОК жанындағы Жоғары партия мектебі базасында 1942 жылы құрылған).
Негіздеме: Қазақстан Республикасы Президентінің 1994 жылғы 29 тамыздағы № 1845 Жарлығы.
1998 ж. – Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы ҰЖМБМ және Қазақстан Республикасы Үкіметінің жанындағы Мемлекеттік қызметшілерді қайта даярлау және олардың біліктілігін арттыру институтының бірігуі арқылы Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Мемлекеттік қызмет академиясы құрылды.
Негіздеме: Қазақстан Республикасы Президентінің 1998 жылғы 18 қыркүйектегі № 4078 Жарлығы.
2000 ж. – Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Мемлекеттік қызмет академиясының елорда – Астана қаласына қоныс аударуы.
2005 ж. – «Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Мемлекеттік қызмет академиясы», «Қазақстан Республикасы Жоғарғы сотының жанындағы Сот академиясын» біріктіру және «Л.Н.Гумилев атындағы Еуразия ұлттық университеті» РМҚК Дипломатиялық академиясының функцияларын жаңадан құрылатын мемлекеттік мекемеге беру арқылы Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Мемлекеттік басқару академиясы құрылды.
Негіздеме: Қазақстан Республикасы Президентінің 2005 жылғы 31 мамырдағы № 1583 Жарлығы.
2008 ж. – Академия мемлекеттік мекемеден республикалық мемлекеттік қазыналық кәсіпорны (РМҚК) болып қайта құрылды.
Мемлекеттік қызметшілердің жоғары буынын қайта даярлау мақсатында Академия құрамында Мемлекеттік саясаттың ұлттық мектебі құрылды. Қазақстан Республикасы Мемлекеттік қызмет істері министрлігі Академияның мемлекеттік басқару органы болып айқындалды.
Негіздеме: Қазақстан Республикасы Президентінің 2008 жылғы 28 қарашадағы № 698 Жарлығы.
2012 ж. – Академияны реформалау бойынша Еуропалық Одақпен бірлескен жобаны іске асыру басталды. Академияның даму Тұжырымдамасы қабылданды (2012 жылдың мамыры) және іске асырылуда. Қазақстанның мемлекеттік қызмет үшін жаңа тұрпатты магистрлер мен ғылым докторларын даярлау бойынша әлемде танылған MPA (Master of Public Administration), MPP (Master of Public Policy), DPA (Doctor of Public Administration), DPP (Doctor of Public Policy) білім бағдарламалары алғаш рет енгізілді.
2014 ж. – Қазақстан Республикасы Президентінің жанындағы Мемлекеттік басқару академиясының 2020 жылға дейінгі Даму стратегиясы бекітілді, жаңа бағыттарды дамытудың құзыреттілік және практикаға бағдарланған тәсілі негізінде мемлекеттік қызметшілерді оқыту жүйесін одан әрі жаңғырту мақсатында және ТМД, ШЫҰ елдеріндегі білім беру қызметтері нарығында бәсекеге қабілеттілікті арттыру қажеттілігіне байланысты әзірленді.